آگارز (استاندارد) – AGAROSE

آگارز (Agarose) یک پلیمر خطی استخراج شده از آگار است که طی فرآیندهای خالص‌سازی، بخش باردار آگاروپکتین از آن حذف شده است. این ماده پودری سفید و بسیار نرم است که با حل شدن در بافرهای الکتروفورز (مانند TAE یا TBE) و جوشاندن، شبکه‌ای ژلی با منافذ کنترل‌شده تشکیل می‌دهد. گرید استاندارد (Standard LE) پرکاربردترین نوع آگارز در آزمایشگاه‌های ژنتیک است و برای جداسازی قطعات DNA و RNA در محدوده اندازه وسیع (از ۵۰۰ جفت‌باز تا ۲۰ کیلو جفت‌باز) ایده‌آل می‌باشد. خلوص بالای این محصول و فقدان آنزیم‌های DNase و RNase تضمین می‌کند که نمونه‌های ارزشمند اسید نوکلئیک در حین الکتروفورز تخریب نشوند.

ژل آگارز استاندارد دارای شفافیت بالایی است که امکان مشاهده واضح باندها را پس از رنگ‌آمیزی با اتیدیوم بروماید یا رنگ‌های ایمن (مانند GelRed) زیر نور UV فراهم می‌کند. همچنین “زمینه” (Background) فلورسانس بسیار کمی دارد که حساسیت تشخیص را بالا می‌برد. این ژل استحکام مکانیکی خوبی دارد و به راحتی نمی‌شکند، بنابراین جابجایی آن برای تصویربرداری آسان است. علاوه بر الکتروفورز تحلیلی، این آگارز برای “الکتروفورز تهیه” (Preparative) و بازیابی DNA از ژل (Gel Extraction) نیز مناسب است، زیرا هیچ مهارکننده‌ای برای آنزیم‌های بعدی (مانند لیگاز یا اندونوکلئاز) باقی نمی‌گذارد.

کاربردها و مصارف

• الکتروفورز افقی ژل برای جداسازی و آنالیز قطعات DNA و RNA (چک کردن PCR).
• استخراج و خالص‌سازی قطعات DNA از ژل برای کلونینگ و توالی‌ابی.
• بلاتینگ (Southern, Northern) و انتقال اسید نوکلئیک به غشا.
• ایمونودیفیوژن شعاعی (Ouchterlony) برای بررسی واکنش آنتی‌ژن-آنتی‌بادی.

نکات ایمنی

• EEO: الکترواسمز (Electroendosmosis) پایین تا متوسط دارد که برای کاربردهای عمومی بهینه است.
• نقطه ژل: دمای بسته شدن ژل حدود ۳۶ درجه سانتی‌گراد است (کاربری آسان).
• نگهداری: در دمای اتاق و محیط خشک.